O Museu da Anatomia está localizado no próprio Laboratório de Anatomia da Univali, sala 102, compondo peças anatômicas secas e vísceras humanas e de animais, possibilitando ao aluno realizar uma comparação entre a evolução espécies e suas diferenças funcionais.
A coleção começou no início da década de 80, com a construção do antigo Laboratório de Anatomia aumentando seu acervo ao longo dos anos, através de técnicas realizadas por professores, técnicos e alunos da Disciplina de Anatomia.
O Museu semanalmente é visitado por colégios da região, sendo um dos principais pontos do roteiro da Universidade.