Alinhada ao contexto contemporâneo, a proposta metodológica do Colégio de Aplicação pressupõe a formação dos estudantes incentivando-os a busca de sua autonomia intelectual, como agentes de sua história, por meio de um trabalho pedagógico mediado pelo professor que possibilitará vivencias de valores éticos, individuais e coletivos, acesso às mais diversas linguagens, observação, levantamento de hipóteses, exploração, manipulação, reconhecimento, participação, comparação, análise/síntese, generalização, sensibilização e reflexão que contribuirão para seja capaz de construir seu repertório de saberes e de gerenciar sua aprendizagem continuada e viver solidariamente em sociedade.

O processo de avaliação que se dará nas disciplinas objetivando proporcionar ao aluno a possibilidade de fazer uma síntese das experiências educativas durante certo período, situando-se em um conjunto que lhe permita a compreensão cada vez mais ampla e complexa, do homem e da cultura; desenvolver no aluno, a consciência objetiva de si mesmo; possibilitar que o aluno assuma a dinâmica de seu processo educativo, do qual ele próprio é o agente; possibilitar ao professor o controle dos resultados do processo de aprendizagem integrado ao processo educativo global, pelo acompanhamento da aprendizagem, pela avaliação do rendimento do trabalho docente e pelo aproveitamento de elementos que ajudem a orientar o aluno, na superação de suas dificuldades e a um aperfeiçoamento da prática docente; fornecer à Escola dados necessários à verificação da consecução de seus objetivos, e, portanto, ponto de partida para um replanejamento.