De acordo com o Regimento Geral da UNIVALI, o Colegiado do Curso é órgão consultivo em matéria de ensino, pesquisa, extensão e cultura, sendo composto pelo coordenador do curso, quatro docentes escolhidos por seus pares, e dois acadêmicos também escolhidos por seus pares.
O Colegiado funciona como núcleo complementar de tomada das decisões peculiares ao curso, procurando estabelecer as metas e as estratégias condizentes com a realidade circundante.
O atual Colegiado do curso de Engenharia Ambiental e Sanitária possui os seguintes membros:
Coordenador do Curso
Rodrigo Cordeiro Mazzoleni
Docentes
Rafaela Picolotto
Adelita Ramaiana Bennemann Granemann
Cristina Ono Horita
Paulo Ricardo Schwingel
Discentes
Gabriela Iohana Goetten (titular)
Amanda Baptista (suplente)